福利，如何看懂Blast結果圖
眾所周知，同源性是預測基因和蛋白質功能的主要線索，而序列同源性的判斷則離不開兩個或多個序列之間相似性的檢測。一般來說，序列間的相似度越高，它們是同源序列的可能性就越高。
其中，序列比對無疑是評估序列相似性的最簡單方法。顯然，Blast就是序列比對檢測的中堅力量。Blast自1990年首次亮相以來，憑借從各大數據庫（EST、PDB數據庫等）獲取信息的能力，迅速成為序列比對界的領頭羊。?
![福利，如何看懂Blast結果圖]( "福利，如何看懂Blast結果圖")
老實說，Blast的界面非常友好，點擊相應模塊后，大家只需在序列框中丟上自己的靶序列，勾選好物種基因組，點擊搜索即可！?
![福利，如何看懂Blast結果圖]( "福利，如何看懂Blast結果圖")
可看著結果界面涌現出的幾十個、數百個甚至數千個候選匹配序列，不少選擇困難癥的童鞋表示頭疼不已：結果辣么多，究竟哪個才是最優解？本文以NM_001206932為例，分解BLAST結果頁面，讓大家迅速擺脫Blast新手身份。
Blast結果解析：
首先會看到一個表頭，即本次比對的基本信息，如比對類型、序列長度、所選的數據庫等等。如果所選的數據庫不合適，請及時迷途知返哦。?
![福利，如何看懂Blast結果圖]( "福利，如何看懂Blast結果圖")
接下來就是Blast的結果顯示圖（Graphic Summary）：顏色比例尺，其中相似度從高到低排列分別為：紅、紫、綠、藍、黑，紅色區域越多則表示有較好的比對結果。
?![福利，如何看懂Blast結果圖]( "福利，如何看懂Blast結果圖")
而在Blast結果的描述區域，兩個衡量標準最為重要：Max Score和E值（E value），前者匹配片段越長，相似性越高則Score值越大；后者是得到上述Score值的概率的大小。E值越小表示隨機情況下得到該Score值的可能性越低。
![福利，如何看懂Blast結果圖]( "福利，如何看懂Blast結果圖")
而點擊相應注釋名稱，又或者在結果顯示圖（Graphic Summary）中點擊對應的線條，均可以查看比對結果的詳細信息。
其中，Expect(E值)、Identities（一致性）、Gaps（缺失或插入）三項是評價blast結果的標準。E值接近零或者為零時，具體上就是完全匹配了；一致性：匹配上的堿基數占總序列長的百分數。
![福利，如何看懂Blast結果圖]( "福利，如何看懂Blast結果圖")
如此，就可對Blast結果做到了如指掌。
序列比對常用在線工具：
1.?????SimiTriX-SimiTetra
功能：多序列比對相似性展示
網址：http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php
2.?????MUSCLE
功能：運行速度比較快的多序列比對
網址：http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#
3.?????Clustal Omega
功能：DNA、RNA、蛋白的多序列比對
網址：http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/
4.?????ClustalW2
功能：應用較廣泛的多序列比對
網址：http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/
5.?????T-Coffee
功能：準確度高,速度慢的多序列比對
網址：http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/