二代測序結果已出,差異基因一目了然,但是如何通過實驗的方法對數據進一步驗證是很多老師們手足無措的事情,今天,就為大家介紹下常用的二代測序驗證方法。
1?定性定量實驗方案
1.1實時熒光定量qPCR檢測
實時熒光定量PCR(Real-time Quantitative PCR Detecting System,qPCR)作為最常見的二代測序驗證方法,廣泛應用于二代測序結果的定性定量研究。轉錄組測序基于生物信息分析計算出的多基因表達量會存在一定誤差,而qPCR可檢測特定基因的表達豐度,特異性更高。
1.2 Northern-blot
首先通過電泳的方法將不同的RNA分子依據其分子量大小加以區分,然后通過與特定基因互補配對的探針雜交來檢測目的片段。步驟如下:
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2?功能驗證實驗方案
2.1構建過表達株系
DNA片段被轉入特定生物中,與其本身的基因組進行重組,再從重組體中進行數代的人工選育,從而獲得具有穩定表現特定的遺傳性狀的個體。步驟如下:
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2.2小干擾RNA(siRNA)株系
siRNA可經過多種不同轉染(transfection)技術導入細胞內,并對特定基因產生具專一性的敲降(knockdown)效果。步驟如下:
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